Le FGTI a d’abord été mis en place en 1986 pour indemniser les victimes d’actes de terrorisme. Il a été étendu, après 1990, à l’indemnisation de toutes les victimes d’infractions dont les droits sont reconnus par les Commissions d’indemnisations des victimes d’infraction (CIVI).
Le FGTI est financé par la communauté nationale via une taxe sur les contrats d’assurances.